高栋臣,1913年出生于甘肃省天水县元龙乡(今属天水市麦积区)。1925年,随在杨虎城部任职的姐夫前往西安求学。1932年,邓宝珊就任西安绥靖公署驻甘肃行署主任,高栋臣遂赴兰州,后随邓宝珊部被编入新一军第十旅一团,任骑兵连连副。
1938年秋,高栋臣经黄俊旭介绍加入中国共产党。皖南事变爆发后,国共关系日趋恶化,八路军驻兰州办事处及中共甘肃秘密党组织预判内战可能爆发,遂着手组织力量,开展武装斗争。在此背景下,高栋臣等人被派往陇南地区进行活动,后转战至兰州北山一带,组织起一支近百人的游击队伍,活动于皋兰、景泰等地。该部打击土豪劣绅、惩治贪官污吏、救济贫苦百姓,深得当地群众拥护。
1941年秋,高栋臣首次被捕,后经党组织多方营救,得以保释出狱。1942年4月底,他再次被捕入狱。1943年1月5日,高栋臣被国民党当局杀害于兰州,终年30岁。